В феврале 2002 года с целью оказания социальной помощи гражданам и семьям, находящимся в трудной жизненной ситуации, при администрации города Бийска  создано муниципальное учреждение «Центр социальной помощи семье и детям города Бийска».

В 2005 году Центр передан в краевую собственность и продолжил деятельность в статусе краевого учреждения социального обслуживания «Территориальный центр социальной помощи семье и детям города Бийска» при Главном управлении Алтайского края по социальной защите населения и преодолению последствий ядерных испытаний на семипалатинском полигоне.

В июле 2013 года в связи с реорганизацией переименован в краевое государственное учреждение социального обслуживания «Комплексный центр социального обслуживания населения города Бийска». В состав комплексного центра вошли  Территориальные центры социальной помощи семье и детям Бийского, Красногорского, Зонального и Солтонского районов в статусе филиалов, в результате чего была значительно расширена зона обслуживания. В 2017 году в зону обслуживания Центра вошли Быстроистокский и Петропавловский районы, в 2019 году  - город Белокуриха.

С октября 2006 года по июль 2021 г. учреждением руководила Чернова Людмила Филипповна.

С 29 апреля 2022 года Комплексный центр социального обслуживания населения города Бийска возглавила Арутюнян Анна Юрьевна.